Система керування якістю НВП «ЕОС» побудована відповідно до моделі стандарту ISO 9001:2000 та рекомендаціями стандарту ISO 9004:2000, та орієнтована на підходи з позицій процесу підвищення задоволеності споживача за рахунок задоволення його вимог. Система керування якістю містить у собі відповідальність керівництва, організаційну структуру керування якістю, документацію, процеси і ресурси, необхідні для здійснення керування якістю. Сферою застосування системи керування якістю є процеси маркетингу, проектування, закупівель, виробництва.

Система керування якістю НВП «ЕОС» містить наступні процеси:

1. Визначення політики, цілей підприємства.
2. Керування документацією та даними;
3. Документація по якості та протоколи якості;
4. Маркетинг та вивчення ринку;
5. Проектування та розробка;
6. Закупівлі, вхідний контроль;
7. Виробництво ;
8. Керування обладнанням;
9. Контроль та випробування;
10. Внутрішні перевірки якості;
11. Керування продукцією, невідповідної встановленим вимогам;
12. Коригувальні та попереджуючі дії;

Система керування якістю передбачає забезпечення наявності всіх необхідних ресурсів та інформації, які вимагаються для ефективної роботи з реалізації та контролю процесів.

Реалізація процесів системи керування якістю передбачає постійний контроль та аналіз ефективності цих процесів, а також проведення заходів щодо їхнього удосконалювання.

Система якості відповідно до вимог стандарту ISO 9001:2000 сертифікована фірмою TNO Certification B.V. (Нідерланди).